次主力司令哲别翻越帕米尔高原，从阿姆河发源地顺流而下，自东南方迂回向北围攻撒马尔罕。
主力军司令则是成吉思汗和拖雷，他们在正面三个纵队发动攻击吸引敌人注意力时，秘密渡过锡尔河，进入红沙漠，迂回前进，从西北方攻击撒马尔罕的西大门、军事重镇布哈拉城，成功后则向东和其他各路纵队围攻撒马尔罕。
这是个非常冒险的计划，红沙漠对西域的所有人而言都是人间地狱，酷热难耐，忽然飞沙走石，三米之内不见物，很少人能徒步穿越。但成吉思汗认为这个险值得一冒，因为一旦成功，那就如神兵天降于撒马尔罕的背后。
1219年春夏之交，成吉思汗在蒙古草原誓师，宣布西征。人类历史上最光辉的一次远征的序幕缓缓拉开，它当然不是结束，只不过是蒙古多次西征的第一次。
一个意外发生在誓师大会上。祭旗那天凌晨，万里无云，军队集结完毕，正要宰马时，突然黑云压顶，狂风暴雪从天而降，半个时辰，雪深三尺。
